用医保卡买药贵的原因如下：

1、医保部门与药店有协议，市民用医保卡购药能够享受一定的折扣，这样提高了医保卡的使用率和实惠性。

2、医保卡仅能购买《医保目录》中的药品，以基本药物为主，保健品不在折扣范围之内。

3、医保卡内的钱是用户平时缴纳保险费时按比例划给用户的，只不过是专款专用，只能用于购买药和治病，不能购买别的商品，医保卡只能在当地医保中心指定的医院或是药店用。